五百年前，龙（王力宏 配音）突然失踪了，凤（章子怡 配音）暂时顶替龙的职位，玉帝下旨，若三天内找不到龙，生肖就要重选。生肖官们集体出动寻找龙，发现人间女孩小珍竟然握有一枚龙鳞，可能是找到龙的关键线索。
将施奈德回老家之后，四只原本亲如兄弟的神龟由于没有了敌人，于是不再想以往一样一起战斗，而是各自在喜欢的领域内钻研，以往一起行动的忍者神龟们变成了四个独来独往的“独行侠”！ 这时，纽约市中发生一连
