混沌初开之时，世上的第一只妖降世，名元蒂（张磊 配音），被奉为妖祖。千百万年后，昔日妖王孙悟空（边江 配音）被唐僧（苏尚卿 饰）从五行山下救出，悟空答应保护唐僧，前往西天取经。而传说中的妖祖元蒂再次现

本作承接《奥特银河格斗2：巨大阴谋》，讲述奥特英雄们与阿布索留特人之间惊动银河的命运之战。同时新的奥特战士——雷古洛思奥特曼和阿布索留特人的战士——迪亚波罗亦将登场。