地球物理学家田所雄介博士（小林桂树 饰）带领自己的团队前往深海科考，却发现海底出现异常龟裂与乱泥流，在一系列调查之后，他得出来日本列岛在一年后即将沉没的结论。可是日本政府的官员们却认为田所博士的预测只
平静的东京湾突然发生海难，当人们还在猜想是否海底火山爆发时，一只巨大的怪兽冒出水面并登陆城区。日本政府主导成立了“巨大不明生物灾害部”，网罗了国家中的奇人异士加盟，研究发现怪兽是受到放射性污染而诞生出
21世纪的日本，新新人类无心学业，更对数百年前的旧闻掌故兴致索然。担任某高中教师的川边未香子（石原里美饰）面对这群孩子也只能虚与委蛇，得过且过。某天傍晚，未香子卷入了学生高濑雅也（柄本时生饰）、森野惠
